close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: eddb3517laca,lacy,lacz417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.


Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b0116
Related (b0116): c0145   ECs0120   t0160   UTI89_C0129   VC2412   Z0126  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
lpd 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

lpd b0116 gene,CDS,mat_peptide dhl; ECK0115; JW0112; lpdA 127912,127915 129336,129333 1425,1419 cw pdhR-aceEF-lpd arcA-, crp+-, fis+, fnr+-, fruR-, pdhR- rpoD, rpoD, rpoS 1.1.1.20, 1.1.3.5, 1.3.3, 1.3.4, 1.3.6, 1.3.7, 1.7.17, 1.7.21, 7.1 1CMET2-PWY, ANARESP1-PWY, GLYCLEAV-PWY, GLYCOLYSIS-TCA-GLYOX-BYPASS, PWY-5084, PYRUVDEHYD-PWY, TCA, TCA-GLYOX-BYPASS lipoamide dehydrogenase, E3 component is part of three enzyme complexes enzyme; Energy metabolism, carbon: Pyruvate dehydrogenase, lipoamide dehydrogenase (NADH); component of 2-oxodehydrogenase and pyruvate complexes; L-protein of glycine cleavage complex,
Accessions

 1.1376 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer