close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b1040
Related (b1040): c1302   ECs1417   t1778   UTI89_C1161   Z1673  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
csgD 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PRODUCT FUNCTION NOTE

csgD b1040 gene,CDS agfD; ECK1026; JW1023 1101769 1102419 651 ccw csgDEFG cpxR-, crp+, csgD+, gadE-, ihfA+, ihfB+, mlrA+, ompR+, rcsA-, rcsB-, rstA- rpoD, rpoS 2.2.2, 3.1.2.2, 5.12 DNA-binding transcriptional activator for csgBA putative regulator; Not classified putative 2-component transcriptional regulator for 2nd curli operon
Accessions

 1.2384 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer