close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b1562
Related (b1562): ECs1080   UTI89_C1474   Z1342  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
hokD 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PRODUCT FUNCTION NOTE

hokD b1562 gene,CDS ECK1556; JW1554; relF 1643143 1643298 156 ccw relBE-hokD relB-, relE- rpoD 8.1 Qin prophage; small toxic polypeptide factor; Cell killing, component of addiction module (incomplete); Phage or Prophage Related polypeptide destructive to membrane potential; hokD (relF) regulatory elements are deleted, and the gene is fused to the relBE transcript; evolutionary relic?
Accessions

 1.1067 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer