close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b1954
Related (b1954): c5642   ECs5469   Z3044  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
dsrA 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PRODUCT FUNCTION NOTE

dsrA b1954 gene,ncRNA ECK1952; IS095; JWR0036 2023251 2023337 87 ccw dsrA leuO- rpoD 2.2.7, 3.1.3.6, 5.5.4, 6.3, 7.1 sRNA antisense regulator enhances translation of RpoS, Hfq-dependent 2.2.7 information transfer; RNA related; antisense RNA, 3.1.3.6 regulation; type of regulation; posttranscriptional; antisense RNA, 6.3 cell structure; surface antigens (ECA, O antigen of LPS), 7.1 location of gene products; cytoplasm, regulatory RNA; regulates transcriptional silencing by H-NS protein, and enhances translation of RpoS, RNA; Surface polysaccharides & antigens silencer of rcsA gene, interacts with rpoS translation; component of acid resistance regulatory circuit
Accessions

 1.0657 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer