close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b2621
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
ssrA 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

ssrA b2621 gene,tmRNA ECK2617; JWR0055; sipB 2753615 2753977 363 cw ssrA 2.2.6, 2.3.6, 6.6, 7.1 PWY0-1479 tmRNA, 10Sa RNA 2.2.6 information transfer; RNA related; rRNA, stable RNA, 2.3.6 information transfer; protein related; turnover, degradation, 6.6 cell structure; ribosome, 7.1 location of gene products; cytoplasm, RNA; Ribosomal and stable RNAs acts as tRNA-Ala and mRNA template for tagging proteins resulting from premature transcription termination for degradation, a process known as trans-translation
Accessions

 2.1519 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer