close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: eddb3517laca,lacy,lacz417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.


Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b2978
* Multiple locusTags found for b2978
Combined/Averaged (b2978): b4467,b4468,b2978
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
glcE 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS OLD_LOCUSTAG LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA PATHWAY PRODUCT FUNCTION

glcF b4467 gene,CDS ECK2972; gox; JW5486; yghL b2978 3122258 3123481 1224 ccw glcDEFGBA arcA-, glcC+, ihfA+, ihfB+ rpoD GLYCOL-GLYOXDEG-PWY, GLYCOLATEMET-PWY, GLYOXDEG-PWY glycolate oxidase iron-sulfur subunit enzyme; Central intermediary metabolism: Pool, multipurpose conversions, 1.7.1 metabolism; central intermediary metabolism; unassigned reversible reactions
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS OLD_LOCUSTAG LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

glcE b4468 gene,CDS ECK2973; gox; JW5487; yghL b2978 3123492 3124544 1053 ccw glcDEFGBA arcA-, glcC+, ihfA+, ihfB+ rpoD GLYCOL-GLYOXDEG-PWY, GLYCOLATEMET-PWY, GLYOXDEG-PWY glycolate oxidase FAD binding subunit enzyme; Central intermediary metabolism: Pool, multipurpose conversions, 1.7.1 metabolism; central intermediary metabolism; unassigned reversible reactions glycolate oxidase iron-sulfur subunit
Accessions

 0.9073 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer