close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3125
Related (b3125): c3880   ECs4003   t3168   UTI89_C3556   VCA0007   Z4477  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
garR 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

garR b3125 gene,CDS ECK3113; JW5526; yhaE 3269889 3270773 885 ccw garPLRK-rnpB cdaR+, fnr+, fur-, hns- rpoD 1.1.1.20, 1.1.1.4, 1.1.1.6, 1.7.25 GALACTARDEG-PWY, GLUCARDEG-PWY, GLUCARGALACTSUPER-PWY tartronate semialdehyde reductase 1.1.1 metabolism; carbon utilization; carbon compounds, 1.7.25 metabolism; central intermediary metabolism; glycolate metabolism tartronate semialdehyde reductase (TSAR)
Accessions

 1.0969 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer