close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3164
Related (b3164): c3920   ECs4045   t3200   UTI89_C3594   VC0647   Z4525  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
pnp 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

pnp b3164 gene,CDS bfl; ECK3152; JW5851 3307055 3309190 2136 ccw metY-rimP-nusA-infB-rbfA-truB-rpsO-pnp argR-, crp-, fis+ rpoD 1.2.1, 2.2.4, 7.1 PWY0-1479 polynucleotide phosphorylase/polyadenylase enzyme; RNA synthesis, modification, DNA transcription, 1.2.1 metabolism; macromolecule degradation; RNA, 2.2.4 information transfer; RNA related; RNA degradation, 7.1 location of gene products; cytoplasm polynucleotide phosphorylase; cytidylate kinase activity
Accessions

 1.0720 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer