close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: eddb3517laca,lacy,lacz417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.


Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3405
Related (b3405): c4181   ECs4247   t4004   UTI89_C3905   VC2714   Z4760  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
ompR 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

ompR b3405 gene,CDS ECK3392; JW3368; kmt; ompB 3533887 3534606 720 ccw ompR-envZ crp+-, ihfA-, ihfB- rpoD 2.2.2, 3.1.2.2, 3.1.2.3, 3.1.2.4.3, 3.3.1, 6.1, 7.1 PWY0-1500 DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EnvZ regulator; Global regulatory functions response regulator (sensor, EnvZ) affecting transcription of ompC and ompF: outer membrane protein synthesis
Accessions

 0.8363 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer