close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3420
Combined/Averaged (b3420): b4475,b3419,b3420
Related (b3420): c4197   ECs4263   UTI89_C3920   Z4778  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
rtcA 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS OLD_LOCUSTAG LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA PRODUCT FUNCTION

rtcA b4475 gene,CDS ECK3406; JW5688; yhgJ; yhgK b3419, b3420 3553855 3554871 1017 ccw rtcBA ihfA+, ihfB+, rtcR+ rpoN RNA 3'-terminal phosphate cyclase enzyme; RNA synthesis, modification, DNA transcription, 2.2 information transfer; RNA related, 2.2.3 information transfer; RNA related; RNA modification, 7.1 location of gene products; cytoplasm
Accessions

 1.0664 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer