close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: eddb3517laca,lacy,lacz417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.


Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3460
Related (b3460): c4253   ECs4309   t3955   UTI89_C3969   Z4834  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
livJ 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PRODUCT FUNCTION NOTE

livJ b3460 gene,CDS,mat_peptide ECK3444; hrbB; hrbC; hrbD; JW3425 3596578,3596581 3597681,3597612 1104,1032 ccw livJ lrp- rpoD 1.5.1.18, 1.5.1.19, 4.3.A.1.p, 4.S.108, 4.S.154, 7.2 leucine/isoleucine/valine transporter subunit transport; Transport of small molecules: Amino acids, amines, 1.5.1.18 metabolism; building block biosynthesis; amino acids; isoleucine/valine, 1.5.1.19 metabolism; building block biosynthesis; amino acids; leucine, 4.3.A.1.p transport; Primary Active Transporters; Pyrophosphate Bond (ATP, GTP, P2) Hydrolysis-driven Active Transporters; The ATP-binding Cassette (ABC) Superfamily + ABC-type Uptake Permeases; ABC superfamily, periplasmic binding component, 7.2 location of gene products; periplasmic space, 4.S.108 transport; substrate; L-leucine/L-valine/L-iso-leucine, high-affinity branched-chain amino acid transport protein (ABC superfamily, peri_bind); periplasmic-binding component of ABC superfamily,
Accessions

 1.0693 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer