close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3788
Related (b3788): c4708   ECs4721   t3375   UTI89_C4344   Z5299  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
rffG 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION

rffG b3788 gene,CDS ECK3780; JW5598; rff 3970545 3971612 1068 cw rfe-wzzE-rffEDGHCA-wzxE-rffT-wzyE-rffM nsrR- rpoD 1.6.3.1, 1.6.4, 6.1, 6.3 ECASYN-PWY dTDP-glucose 4,6-dehydratase enzyme; Central intermediary metabolism: Sugar-nucleotide biosynthesis, conversions, 1.6.4 metabolism; macromolecules (cellular constituent) biosynthesis; enterobacterial common antigen (surface glycolipid), 6.3 cell structure; surface antigens (ECA, O antigen of LPS)
Accessions

 1.0695 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer