close[X]
Email Address
Password
forgot password?
Welcome to the E. coli Gene Expression Database (GenExpDB)                 

Instructions:  Search by gene, locus or location (multiple entries separated by comma or space).

*To start:   enter query or select Example: edd • b3517 • laca,lacy,lacz • 417500             
Search by:      Operon Regulon Sigma Annotation Experiment MultiFun


Reference Genome set to Ecoli MG1655. Click Settings to change RefSeq genome annotation.

Genome: E. coli MG1655
Query: ( 1 ) b3794
Related (b3794): c4716   ECs4728   t3368   UTI89_C4352   VC0927   Z5306  
Heatmap of gene expression ratios from all experiments for your query, displayed colorimetrically. Mouseover heatmap bars to display experiment information. Click on heatmap bar to display experiment in: ScatterPlot LinePlot JBrowse
rffM 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
                                                                                                                                                                                                                                 
Exp: 1145 / 1292
Browser    ( powered by JBrowse )
Annotation
META LINKS GENE LOCUS FEATURE SYNONYMS LEFT END RIGHT END LEN DIR OPERON REGULATED BY SIGMA MULTIFUN PATHWAY PRODUCT FUNCTION NOTE

rffM b3794 gene,CDS ECK3787; JW3770; rff; wecG 3977979 3978719 741 cw rfe-wzzE-rffEDGHCA-wzxE-rffT-wzyE-rffM nsrR- rpoD 1.6.4, 6.1, 6.3 ECASYN-PWY UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid transferase enzyme; Central intermediary metabolism: Sugar-nucleotide biosynthesis, conversions, 1.6.4 metabolism; macromolecules (cellular constituent) biosynthesis; enterobacterial common antigen (surface glycolipid), 6.3 cell structure; surface antigens (ECA, O antigen of LPS) probable UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid transferase; synthesis of enterobacterial common antigen (ECA)
Accessions

 1.0576 sec
Copyright © 2015 - Oklahoma State University | All Rights Reserved | Disclaimer